Hiện nay, hướng thoát nước chính cho toàn bộ khu bay của Cảng là đổ ra sông Cửa Lấp rồi thoát ra biển. Tuy nhiên khu vực cửa sông Cửa Lấp và đoạn kết nối mương thoát nước của khu bay hàng năm bị bồi lấp nặng, gây cản trở lớn đến dòng chảy thoát nước ra biển. Một phần nguyên nhân do các hoạt động xây dựng nằm ở khu vực cửa sông Cửa Lấp đã san lấp mặt bằng, lấn bờ làm hẹp dòng chảy, dẫn đến việc thoát nước từ khu bay ra biển rất chậm.

Ngoài ra, tình trạng người dân tái chiếm đất ở khu vực phía bắc đường cất hạ cánh của Cảng HKQT Phú Quốc diễn biến phức tạp. Người dân chiếm đất, san lấp mặt bằng đã lấp phần lớn mương thoát nước (mương M1) gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến việc thoát nước tự nhiên trong mùa mưa bão tại khu vực phía Đông, Đông Bắc đường cất hạ cánh ra sông Cửa Lấp, ảnh hưởng rất lớn đến an toàn khai thác tại Cảng (điển hình là vụ việc ngày 09/8/2019, khu bay của cảng hàng không Phú Quốc bị ngập lụt do tắc nghẽn đường thoát nước ra sông Cửa Lấp, Cảng phải tạm ngưng tiếp thu tàu bay trong thời gian từ 9h30 đến 20h30, cùng ngày hủy gần 70 chuyến bay đi/đến).
Theo đó, để đảm bảo tuyệt đối an toàn khai thác tại Cảng HKQT Phú Quốc, Cục Hàng không Việt Nam đề nghị Ủy ban nhân dân tỉnh Kiên Giang hỗ trợ nạo vét khu vực sông Cửa Lấp vào cuối mùa khô và trước mùa mưa nhằm đảm bảo yêu cầu thoát nước từ hệ thống mương khu bay của Cảng; quản lý chặt chẽ hoạt động xây dựng tại lưu vực sông Cửa Lấp để hoạt động xây dựng không làm ảnh hưởng đến dòng chảy sông Cửa Lấp. Đồng thời có phương án xử lý dứt điểm tình trạng lấn chiếm đất tại Cảng HKQT Phú Quốc để triển khai phục hồi các mương thoát nước đã bị các hộ dân lấn chiếm đất lấp đi./.
Trong hai ngày 17 và 18/9/2026, Cục Hàng không Việt Nam đã tổ chức buổi tham vấn với Đoàn đại biểu Bộ Hàng không dân dụng Ấn Độ nhằm trao đổi về việc phát triển vận tải hàng không và tăng tải cung ứng trên các đường bay giữa Việt Nam và Ấn Độ.
Bộ Xây dựng vừa có văn bản gửi Tổng công ty Cảng hàng không Việt Nam; Công ty Cổ phần Đầu tư và Phát triển Vân Đồn; Công ty Cổ phần Cảng hàng không Mặt Trời; Công ty Cổ phần Hạ tầng hàng không Masterise để triển khai lập kế hoạch đầu tư xây dựng cải tạo, nâng cấp, mở rộng các cảng hàng không.
Tại Hà Nội, Bộ Xây dựng tổ chức Hội nghị tham vấn về Báo cáo tổng kết thực hiện Quyết định số 876/QĐ-TTg và dự thảo Quyết định phê duyệt Chương trình hành động chuyển đổi năng lượng xanh, giảm phát thải khí nhà kính trong lĩnh vực giao thông vận tải.